第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量测定基因表达
在不同样品中进行基因表达量的相对值测定时,选择合适的内参基因至关重要。选择内参基因时应遵循以下原则:
- (1) 选择表达稳定且丰丰的基因作为内参基因;
- (2) 避免盲目选用常用的内参基因;
- (3) 常见的内参基因包括GAPDH、Actin和Tublin。
内参基因的选择直接影响结果的有效性。引入内参基因后,可以进行准确的结果计算。
二、绝对定量
绝对定量是通过标准品来测定样品中基因表达量的绝对值(拷贝数)。标准品可以包括以下几类:
- A/ 克隆质粒;
- B/ PCR产物;
- C/ cDNA(注意:此方法用于扩增效率测定等用途,不适用于绝对定量)。
计算拷贝数时,需要平均分子量(MW)的信息:
- dsDNA = (碱基数) x (660 道尔顿/碱基);
- ssDNA = (碱基数) x (330 道尔顿/碱基);
- ssRNA = (碱基数) x (340 道尔顿/碱基)。
拷贝数计算公式为:
(602x1023 拷贝数/摩尔) x (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml。
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