01 科学假说的提出
02 科学假设的结构
C分子 → D通路 → F功能 → X疾病
1. 筛选分子(相关性研究):C → X
组织水平:针对肿瘤组织样本中的富集基因及其代谢途径与功能的研究
临床水平:分析基因表达水平与多种临床指标(如恶性程度、转移与否、耐药性、生存率等)的相关性
2. 寻找机制(机制研究):C → D
分子水平:研究相互结合、表达调控、翻译后修饰、降解调控、剪切调控、胞内定位和激酶信号传导等方面
3. 证实功能(功能研究):C → F
细胞水平:探讨细胞的生长、凋亡、转移、侵润、血管新生和耐药等功能
动物水平:评估肿瘤形成、转移能力和药物敏感性
(二)结构的扩展
A分子 → B分子 → C分子 → D通路 → F功能 → X疾病
A分子:上游主角
C分子:下游主角
研究更倾向于聚焦于“坏”的主角分子在疾病发生中上调的情况,这类分子往往容易成为生物标志物;少数情况下也会关注“好”分子,即在疾病中表达下调的分子,采用一些干预手段使“好”分子上调,从而改善疾病。
B分子:工具分子
1. 通过RNA拉下实验鉴定与RNA结合的工具蛋白,如翻译因子和剪接因子;
2. 通过RIP-seq技术寻找与蛋白结合的RNA;
3. 通过ChIP-seq确定功能蛋白结合的DNA序列,如靶基因。
(三)单细胞测序背景下的结构创新
C基因 → D通路 → E细胞亚型 → F功能 → X疾病
在《Nature Immunology》2022年10月的一项研究中,单细胞谱系分析揭示了慢性鼻窦炎中的炎症异质性机制(如Alox15+巨噬细胞通过分泌趋化因子招募嗜酸性粒细胞、单核细胞及TH2细胞等,这些细胞在eCRSwNP的发生和发展过程中发挥重要作用;而使用ALOX15抑制剂能够有效缓解由2型免疫反应过度激活引起的病理损伤)。
03 科学假说的深度
1. 线性结构:A → B → C → D
2. 环形结构:常见的有负反馈调控通路,例如一个生化反应产生的A能够抑制其自身的产生,这种反馈调节即为负反馈调控。经典案例包括miRNA的调控。
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